m1A-meRIP-seq

m1A(N1-methyladenosine)便是其中之一,该修饰在非编码RNA和mRNA上普遍存在,在人类细胞中,m1A存在于线粒体tRNA和细胞质tRAN的9位和第58位核糖腺苷酸上,m1A修饰在维持这些非编码RNA的结构和功能方面起着重要作用。除了存在于非编码RNA,在于哺乳动物mRNA上也存在m1A修饰,且在5’UTR区有较多的呈现。

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m5C-meRIP-seq

5-甲基胞嘧啶(5-Methylcytosine,m5C),在RNA中广泛分布,早在上世纪70年代就已发现存在于mRNA上。当时由于技术的局限性,一直未能充分研究。近期研究发现mRNA m5C在哺乳动物中的分布十分保守,在不同组织中修饰的基因具有特异性。随着NGS的广泛应用,RNA修饰研究已是表观遗传领域的热点,而m5C-RIP-seq则是研究m5C修饰强有力的技术之一。

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m6A修饰(N6-methyladenosine),是指在RNA腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰,修饰位点附近序列高度保守,随着NGS的广泛应用,RNA修饰得到了广泛研究,已是表观遗传领域的热点,而MeRIP-seq则是研究m6A修饰强有力的技术之一。

m6A-meRIP-seq

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m7G修饰,是一种自带正电荷的RNA甲基化修饰,在甲基化转移酶的作用下,使RNA鸟嘌呤(G)的第七位氮原子加上甲基的一种化学修饰。m7G RNA甲基化修饰常存在于真核生物mRNA 5’帽子结构,具有调控mRNA的转运,翻译,剪切过程,除了存在于5’帽子结构外,m7G也存在于tRNA和rRNA序列内部。

m7G-meRIP-seq

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ac4C(N4-acetylcytidine,N4位乙酰胞嘧啶)是一种真核原生生物保守的化学修饰。首次发现于细菌tRNA met的反密码子第一位,其存在保证了翻译过程的准确性,近期研究显示mRNA上也存在大量的ac4C。该修饰可以促进蛋白翻译,影响RNA的稳定性与可变剪切,调控基因表达。

acRIP-seq

2'-O-RNA-seq

RNA修饰是指发生在RNA分子上的各种化学修饰(已超160种),每种修饰都有相应的功能,如:稳定结构、出核运输、可变剪接、翻译识别等。

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