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ATAC-seq 技术,全称为: Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing该方法通过超活化 Tn5 转座酶将序列接头插入到染色质开放区域,然后通过 DNA 测序数据分析推断染色质各区域的可及性、转录因子结合位点以及核小体位置。 ATAC-seq 可以在全基因组范围快速灵敏地检测染色质可及性

ATAC-seq

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CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation, CUT&Tag)是一种研究蛋白质与DNA互作的新方法。该方法通过分子生物学手段将高活性的Tn5转座酶与Protein A融合,并装载建库接头引物形成pA-Tn5转座复合物。在抗体的引导下该pA-Tn5转座复合物可靶向切割目的蛋白附近的DNA序列。

CUT&Tag

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该技术用于鉴定DNA与相关蛋白结合的部位,可对目标蛋白在全基因组上的结合位点进行精确定位。在活细胞内固定DNA与蛋白结合的复合体,然后用蛋白特异性的抗体,通过抗原抗体特异性结合的免疫学手段捕获该复合体,然后洗脱蛋白质,得到与目的蛋白结合的DNA片段,将富集到的DNA片段进行上机测序。测序成本的降低让ChIP-seq成为表观研究的利器之一。

ChIP-seq