环状DNA的过去和未来

ecDNA是什么？ecDNA的中文名字叫做染色体外DNA（Extrachromosomal DNA）。其实，这并不是一个新鲜的词汇，染色体物质在常染色体组之外的存在已经被认识很久了，它们与癌基因的扩增及癌症发生发展的关系也早已被研究者发现。但是，ecDNA它也并不像其他分子如非编码RNA那样被大众广知。

2020-10-23

ATAC-seq

ATAC-seq的结果具有很强的一致性，同时也和基于组蛋白修饰marker的ChIP-seq有较高的吻合程度。另外，ATAC-seq的重复性，比MNase-seq和DNase-seq的更强，操作起来也更加简单，细胞或组织的需求量较少，出来的信号更加漂亮。已是目前研究染色质开放性首选的技术方法。

2020-10-19

RIC-seq

RIC-seq可以“一网打尽”式的鉴定出细胞内各种RNA-RNA空间相互作用，包括以前看不到的RNA三级空间邻近相互作用。RIC-seq数据，既能检测RNA的高级结构，也能准确鉴定各种lncRNA的作用靶标，能够用于lncRNA结构及功能研究。此外，该技术在病毒RNA的结构和靶标研究方面也有广阔的应用前景(Cai et al., 2020)。

2020-10-19

Circle-seq

目前研究eccDNA强有力的方式之一是Circle-seq技术，基于质粒提取、酶切消化和高通量测序技术，根据线性DNA和环状DNA结构和化学性质的差异性，将裂解细胞通过柱纯化、去除线性DNA、滚环式扩增，三大步骤进行eccDNA的富集，结合高通量测序获取eccDNA的序列信息。

2020-10-19