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    GUIDE-seq,即Genome-wide Unbiased Identification of DSBs Enabled by Sequencing的缩写,是一种用于基因编辑断裂点和脱靶位点识别的方法。该方法的核心在于利用特定的寡核苷酸(dsODN)标记基因组中的双链断裂(DSB)位点。

    GUIDE-seq

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    CIRCLE-seq,全称为 Circularization for in vitro reporting of cleavage effects by sequencing,是基于体外成环和切割的基因编辑断裂点与脱靶位点识别方法。它先将基因组 DNA 片段化并环化,基因编辑工具切割后,对线性化片段测序来定位相关位点 。

    CIRCLE-seq

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    靶向扩增子测序是一种针对特定基因组区域展开深度遗传变异检测的技术。它先选定目标区域,设计特异性引物对目的片段进行扩增,让原本含量低的目标序列数量大幅增加 。

    靶向扩增子测序

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    PE技术通过融合Cas9切口酶和逆转录酶,利用引导编辑向导RNA(pegRNA)实现精准编辑。其核心是通过pegRNA引导Cas9切口酶切割非靶向链,再由逆转录酶以pegRNA为模板合成新的DNA片段,最终整合到基因组中。这一过程理论上可实现碱基替换、片段插入或删除等编辑。

    PE 编辑脱靶技术