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GUIDE-seq,即Genome-wide Unbiased Identification of DSBs Enabled by Sequencing的缩写,是一种用于基因编辑断裂点和脱靶位点识别的方法。该方法的核心在于利用特定的寡核苷酸(dsODN)标记基因组中的双链断裂(DSB)位点。
GUIDE-seq
CIRCLE-seq,全称为 Circularization for in vitro reporting of cleavage effects by sequencing,是基于体外成环和切割的基因编辑断裂点与脱靶位点识别方法。它先将基因组 DNA 片段化并环化,基因编辑工具切割后,对线性化片段测序来定位相关位点 。
CIRCLE-seq
PE技术通过融合Cas9切口酶和逆转录酶,利用引导编辑向导RNA(pegRNA)实现精准编辑。其核心是通过pegRNA引导Cas9切口酶切割非靶向链,再由逆转录酶以pegRNA为模板合成新的DNA片段,最终整合到基因组中。这一过程理论上可实现碱基替换、片段插入或删除等编辑。
PE 编辑脱靶技术
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