达澈小讲堂
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随着NGS的全面推广和应用,大数据时代的来临,让表观组学的研究进入全新时代,越来越多的研究人员也都摩拳擦掌步入生物信息分析的行列。啥是Circle-seq?如何用来研究ecDNA的?RIC-seq又是啥?路漫漫其修远兮,达澈将从原理开始,结合实验,梳理思路,再到数据分析,一次性扫除科研道路上的障碍!
助力科研 | NGS热点技术+定制化解读一起来啦!~
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是研究蛋白质与DNA互作的新方法,相比于ChIP-Seq,该技术无需交联与超声打断操作,规避了抗原决定簇遮盖和样本损失问题,提高了信噪比,重复性好、实验周期短,自2019问世后便得到广泛应用
干货 | 啥?植物的CUT&Tag不好做?看看人家棉花和水稻!~
上期以文案方式讲解了eccDNA的Junction鉴定方法(参见公众号)。
本期将用视频方式,详细讲解鉴定的流程:eccDNA的挑选、IGV筛选、reads的选择、引物设计、一代测序结果解读等。
通过视频讲解,希望能帮助到大家!~
全网首发 | 详细解读eccDNA的Junction鉴定方法
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单细胞双组学深度解析:从scRNA scATAC 整合到调控网络构建的完整路线
面对“同一细胞的配对数据”(Paired)与“不同样本的非配对数据”(Unpaired)两种截然不同的实验设计,如何选择算法、如何跨越模态鸿沟,仍是许多研究者的痛点。
넶4 2026-06-30 -
scATAC-seq vs scCUT&Tag:基于课题研究目的的技术选型指南
scATAC-seq与scCUT\x26amp;Tag是单细胞表观遗传研究的两大核心技术,二者均能实现单细胞分辨率的染色质调控解析,但核心检测靶点、技术原理与科研价值完全不同。
넶5 2026-06-29 -
单细胞至空间的主流映射算法对比
单细胞组学和空间组学的联合分析中,一个重要流程是将单细胞组的数据投射至相应空间组学数据中的空间上,以方便后续分析空间中同一位置的多个组学数据。
넶20 2026-06-23 -
单细胞CRISPR的靶向sgRNA设计要点
单细胞CRISPR筛选的发展更是实现了“基因扰动 - 转录组表型”的单细胞水平精准关联。在这一技术体系中,靶向sgRNA的设计质量与单细胞水平的高效递送是决定实验成败的两大核心因素。
넶10 2026-06-15 -
当同一个spot的RNA和蛋白表达矛盾——空间多模态置信度评估
在同一组织切片的同一像素(spot)或单细胞内同时测量RNA转录本和蛋白质表达。mRNA丰度与蛋白丰度之间的相关性,在空间维度上往往低得令人意外。本文将围绕这个问题展开。
넶8 2026-06-11
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