免疫沉淀 - 质谱联用技术IP-MS
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IP-MS(免疫沉淀 - 质谱联用技术)是研究蛋白质相互作用的核心手段之一,其原理是利用抗原抗体的特异性结合,先通过免疫沉淀捕获目标蛋白及其相互作用分子,再结合质谱技术对复合物中的蛋白质进行鉴定与分析。该技术整合了免疫沉淀的高特异性和质谱的高通量检测能力,能系统解析蛋白质间的相互作用网络,为理解生物过程的分子机制提供关键线索。 IP-MS 的实验流程主要包括样品制备、免疫沉淀和质谱分析三大步骤。首先通过细胞裂解获得总蛋白提取物,随后利用偶联抗体的磁珠或琼脂糖珠特异性吸附靶蛋白及其复合物,经多次洗涤去除非特异性结合的杂质后,对富集的蛋白进行酶解消化,生成的肽段通过液相色谱 - 质谱联用(LC-MS/MS)系统分离并鉴定,最终结合数据库匹配确定蛋白质组成及相对丰度。 该技术广泛应用于基础研究和转化医学领域,例如在信号通路解析中发现新的调控蛋白,在疾病机制研究中鉴定异常的蛋白质复合物,或在药物研发中验证候选靶点的相互作用分子。随着质谱灵敏度和定量精度的提升,IP-MS 已成为探索蛋白质组动态互作的重要工具,为揭示生命活动规律和疾病发生机制提供了强大支撑。
IP-MS
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1. 免疫沉淀 - 细胞裂解:PBS洗细胞,加3倍体积裂解缓冲液冰浴30min,离心取上清,定量后分装保存。 - 抗体偶联磁珠:磁珠洗涤后加抗体孵育,再洗涤备用。 - 共沉淀:裂解液加抗体磁珠孵育过夜,洗涤后洗脱,样本电泳染色取胶条。
2. 质谱检测 - 胶内酶解:胶条切粒,脱色、还原、烷基化后加胰酶孵育,提取肽段脱盐复溶。 - 质谱检测:肽段经液相分离,联用质谱仪以DDAPaSEF模式采集数据(扫描范围100-1700m/z)。
3. 数据分析 - 用SpectroMine软件按参数搜库。 - 进行韦恩图、GO、KEGG及PPI网络分析。 - 结果分类保存。
实验流程
分析流程
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