宏蛋白组学（metaproteomics）
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宏蛋白组学（Metaproteomics）是研究特定环境中微生物群落表达的全部蛋白质的科学，通过质谱技术直接鉴定和定量复杂样本（如肠道、土壤、水体）的蛋白质组成，揭示微生物群落的实时功能活性及与宿主的相互作用。相较于宏基因组学，它能更精准反映微生物的实际代谢状态，例如在疾病研究中识别与炎症性肠病、肥胖相关的功能蛋白，或在环境监测中追踪污染物降解的关键酶。
该技术通过分析蛋白质的动态变化，成为连接基因潜力与真实功能的桥梁，广泛应用于医学诊断（如筛选胃癌生物标志物）、环境修复（评估微生物降解能力）及食品发酵优化。其核心价值在于直接捕捉微生物群落的"工作状态"，为理解宿主-微生物互作机制提供不可替代的视角。
宏蛋白组学（metaproteomics）
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1.样本采集与处理 采集环境样本（如土壤、水体、肠道内容物等），注意避免污染，快速冷冻保存。 根据样本类型优化蛋白提取方法，去除杂质和非目标生物成分。
2.蛋白酶解与肽段制备 使用胰蛋白酶等酶将蛋白裂解为肽段，提高质谱检测效率。
3.质谱检测 采用液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）技术分离和鉴定肽段，数据依赖性采集（DDA）或数据非依赖性采集（DIA）模式可提高检测深度和准确性。
4.数据库构建与搜索 利用公共数据库（如UniProt、NCBI-NR）或基于宏基因组数据构建定制化数据库，提高蛋白鉴定的特异性和准确性。
5.数据分析与功能注释 鉴定蛋白质种类，进行物种分类和功能注释（如Gene Ontology、KEGG通路分析），解析微生物群落的功能和相互作用。
6.结果整合与生物学意义挖掘 结合样本元数据（如环境条件、实验处理），分析蛋白表达变化与生物学功能的关系，揭示微生物群落的生态作用。
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2023年12月，西班牙科尔多瓦大学Tomas Cerdo等人在Cell Host & Microbe（IF=30.3）期刊上发表了题为“Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice”的文章。该研究利用16S rRNA测序技术发现了与认知能力相关的肠道微生物特征，宏蛋白质组学、靶向代谢组学分析揭示了微生物组氨酸裂氨酶和组氨酸代谢物与认知之间的关联，肠道微生物群可能通过调节与认知功能相关的神经递质和代谢物，从而影响记忆和学习能力。
研究选择了6个月大的健康婴儿，使用贝利婴儿发展量表第三版（BSID-III）评估婴儿的认知、语言和运动技能。根据评估结果，将婴儿分为两组：认知得分高于中位数（Inf-aboveCC）和低于中位数（Inf-belowCC）的婴儿。收集婴儿的粪便样本，使用16S rRNA测序来分析和比较两组婴儿肠道菌群的组成和多样性。同时，利用宏蛋白质组学分析微生物群的功能特征；并使用靶向代谢组学检测粪便、尿液和血液中的组氨酸代谢物，评估微生物群的代谢活动。最后，通过粪菌移植实验，将Inf-aboveCC和Inf-belowCC婴儿的粪菌分别移植到两组小鼠体内，研究不同微生物群对小鼠认知功能的影响。
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1、粪便、土壤和水体等。
2、干冰运输。
3、建议提供备份样品。
注：具体送样细节，请咨询销售。
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