m1A-quant-seq 是一种基于化学或生物化学方法的单碱基分辨率测序技术，用于定量检测 RNA 中 N1 - 甲基腺苷（m1A）修饰的分布和丰度。其核心原理是通过乙二醛和亚硝酸盐介导未甲基化腺苷脱氨形成肌苷，结合高通量测序实现 m1A 位点的高精度识别与绝对定量。该技术可在低至纳克级 RNA 起始量下完成全转录组分析，适用于 mRNA、ncRNA 及线粒体 RNA 等多种类型，并支持单细胞和空间转录组研究。

m1A-quant-seq

极速低损 UBS-seq（Ultrafast Bisulfite Sequencing）是芝加哥大学何川团队开发的超快速亚硫酸氢盐测序技术，用于精准检测 DNA 和 RNA 中的 5 - 甲基胞嘧啶（5mC）修饰。其核心突破在于通过优化亚硫酸氢盐配方和高温处理（98°C），将传统 BS-seq 数小时的转化时间缩短至5-9 分钟，同时显著降低 DNA/RNA 降解和背景噪音。

极速低损UBS-seq

TRAC-seq（tRNA 修饰还原与切割测序）是一种革命性的高通量测序技术，可在单核苷酸分辨率下精准解析 tRNA 的N⁷- 甲基鸟苷（m⁷G）修饰图谱。该技术通过化学处理（如 NaBH₄还原与苯胺特异性切割），使 m⁷G 修饰位点产生特征性断裂信号，结合深度测序与生物信息学分析，不仅能定位修饰位点，还能量化修饰水平。

TRAC-seq

RedaC:T-seq 是一种基于化学还原的单碱基分辨率测序技术，用于精准检测 RNA 中 N4 - 乙酰胞嘧啶（ac4C）修饰的分布与丰度。其核心原理是通过 NaBH₄将 ac4C 还原为四氢 - ac4C，导致 cDNA 合成时修饰位点产生 C→T 突变，结合高通量测序实现单碱基精度的修饰定位。该技术支持纳克级 RNA 起始量，可在单细胞水平解析 ac4C 动态，适用于 mRNA、tRNA 等多种类型 RNA 的全转录组分析。

RedaC:T-seq

BID-seq（Bisulfite Induced Deletion Sequencing）是芝加哥大学何川团队开发的单碱基分辨率假尿苷（Ψ）定量测序技术，通过亚硫酸氢盐处理将 Ψ 转化为 Ψ-BS 加合物，在逆转录时产生特异性缺失信号，实现全转录组范围内 Ψ 修饰的精准定位与化学计量分析。

碱基定量假尿苷：BID-seq

m1A（N1-methyladenosine）便是其中之一，该修饰在非编码RNA和mRNA上普遍存在，在人类细胞中，m1A存在于线粒体tRNA和细胞质tRNA的9位和第58位核糖腺苷酸上，m1A修饰在维持这些非编码RNA的结构和功能方面起着重要作用。除了存在于非编码RNA，在于哺乳动物mRNA上也存在m1A修饰，且在5’UTR区有较多的呈现。

m1A-meRIP-seq

5-甲基胞嘧啶（5-Methylcytosine，m5C），在RNA中广泛分布，早在上世纪70年代就已发现存在于mRNA上。当时由于技术的局限性，一直未能充分研究。近期研究发现mRNA m5C在哺乳动物中的分布十分保守，在不同组织中修饰的基因具有特异性。随着NGS的广泛应用，RNA修饰研究已是表观遗传领域的热点，而m5C-RIP-seq则是研究m5C修饰强有力的技术之一。

m5C-meRIP-seq

m7G修饰，是一种自带正电荷的RNA甲基化修饰，在甲基化转移酶的作用下，使RNA鸟嘌呤（G）的第七位氮原子加上甲基的一种化学修饰。m7G RNA甲基化修饰常存在于真核生物mRNA 5’帽子结构，具有调控 mRNA 的转运、翻译和剪切过程的作用，除了存在于5’帽子结构外，m7G也存在于tRNA和rRNA序列内部。

m7G-meRIP-seq

ac4C（N4-acetylcytidine，N4位乙酰胞嘧啶）是一种真核原生生物保守的化学修饰。首次发现于细菌tRNA met的反密码子第一位，其存在保证了翻译过程的准确性，近期研究显示mRNA上也存在大量的ac4C。该修饰可以促进蛋白翻译，影响RNA的稳定性与可变剪切，调控基因表达。

acRIP-seq

m6A修饰（N6-methyladenosine），是指在RNA腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰，修饰位点附近序列高度保守，随着NGS的广泛应用，RNA修饰得到了广泛研究，已是表观遗传领域的热点，而MeRIP-seq则是研究m6A修饰强有力的技术之一。

m6A-meRIP-seq

假尿苷（Ψ）-meRIP-seq 是一种结合免疫沉淀与高通量测序的技术，通过特异性抗假尿苷抗体富集含 Ψ 修饰的 RNA 片段，经测序分析可在全转录组水平鉴定假尿苷修饰位点及丰度。作为 RNA 中最常见的修饰（被誉为 "第五种核苷"），Ψ 通过碳 - 碳糖苷键连接增强 RNA 结构弹性，调控 RNA 稳定性、翻译功能及免疫识别等关键过程。该技术虽类似经典 m⁶A-meRIP-seq 原理，但聚焦于这一丰度仅次于 m⁶A 的修饰。

假尿苷（Ψ）-meRIP-seq